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茄子基因组研究迈入高清时代
发布时间:2019-11-19        

  10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队,于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术,结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法,获得了目前连续性最好的茄科作物基因组,标志着茄子基因组研究迈入了高清时代。

  茄子是茄科最重要的作物之一,在茄属植物中产量和经济价值居第三位。本次公布的茄子参考基因组,Contig N50达到了5.3Mb,Scaffold N50 更是达到了93.9 Mb,序列总长度1155.8 Mb。

  “之前,日本和意大利的团队分别发表了以二代测序技术为主获得的茄子参考基因组。这次我们采用最新的三代测序技术和Hi-C技术获得的茄子基因组,在组装质量和连续性上远远高于国外研究团队的基因组版本。”论文通讯作者、项目负责人王益奎说,“以最近意大利团队发表的茄子基因组为例,其Contig N50 为16.7Kb,而我们的基因组版本Contig N50达到5.3Mb,连续性提高300多倍。”

  通过比较基因组学分析发现,茄子物种特异的646个基因家族和364个阳性选择基因,赋予了茄子特有的性状。研究团队进行了抗病基因的全基因组鉴定,发现在茄子和辣椒中有一个扩张的细菌斑点抗性基因家族,而在番茄和马铃薯中没有。此外,研究团队发现,在茄子、番茄和马铃薯基因组中,多酚氧化酶基因的染色体分布模式高度相似。高质量的茄子参考基因组序列不仅有利于茄科植物的进化研究,更为茄科植物的选育和改良提供了便利。(李晨)

  伊利诺伊大学的研究人员研究了采集和预处理材料的能量消耗,而加州大学伯克利分校的化学家则专注于将生物质转化为葡萄糖,用于制造乙醇。

  10月31日,由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队,于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。

  此次发表的这5篇论文报道了“旅行者2号”探测器进入星际空间时的初步测量数据,并重点比较了与“旅行者1号”穿越的异同之处。

  何宝宏认为,要加强对区块链技术的引导和规范以及对区块链安全风险的研究和分析,密切跟踪发展动态,积极探索发展规律。

  谷歌近日发表于《自然》杂志的论文宣布实现了量子霸权。量子霸权,代表量子计算装置在特定测试案例上表现出超越所有经典计算机的计算能力,实现量子霸权是量子计算发展的重要里程碑。

  这项研究在UCF的推进与能源研究实验室进行,其拥有美国唯一的用于测试高超音速反应的湍流冲击管,该冲击管允许在封闭环境中创建和分析爆炸。

  麻疹是一种传染性很强的病毒性疾病,疫苗接种则是保护儿童免受此病侵扰的最有效手段。

  据悉,北京市农林科学院郭绍贵和孙宏贺、中国农科院赵胜杰和林涛、美国康奈尔大学王昕和吴珊为研究论文的共同第一作者,许勇、刘文革、费章君和黄三文为共同通讯作者。

  德国亥姆霍茨德累斯顿—罗森多夫研究中心(HZDR)和奥地利林茨大学合作,率先开发出一种可同时处理非接触和直接接触刺激的电子传感器。

  团队分析人体样本发现,精神分裂症患者死后脑内MPST基因表达水平显著高于正常人,并且这种蛋白酶在脑内的水平与生前临床症状严重程度相关。

  日光层是太阳创造的一个保护泡,一直延伸到冥王星轨道。现在,通过旅行者探测器,我们对星际空间有了更丰富的认识,可惜,人类至今对其了解仍不过是九牛一毛。

  特别是随着5G的出现,用户对AI应用时延的要求将越来越高,AI芯片与算法的耦合显得尤为迫切。

  11月3日,在中国科幻大会上,中国科协决定正式启动科技与影视融合平台建设,着力打造科技工作者和电影工作者的合作平台。

  美国研究人员发布了迄今已知的关于KRAS抑制剂疗法在人类临床试验中应用的首个报告。结肠直肠癌小鼠模型显示,这种疗法还在肿瘤周围创造了一种促炎性微环境。

  在哈勃太空望远镜近期拍摄的照片中,科学家看到了一张宇宙中的“鬼脸”——一对发光的“眼睛”怒目而视,“鼻子”和“嘴”的轮廓依稀可辨。

  戴德昌和德扬·斯托伊科维奇领导的研究团队发现,虫洞入口与普通黑洞存在区别,而且这些差异可以通过远距离观测发现,不需要飞临或钻入黑洞。

  刘慧也表示,“土壤环境的确很重要,但作物生长还需要满足温度、光照、气体、水和肥料等其他条件。

  中船重工702所4日发布一项科研成果:该所地效翼船研发小组成功研制出地效翼船驾控模拟实训平台(地效翼船模拟器),主要用于开展地效翼船的驾驶培训。

  作为湖北省首个5G示范区,武汉CBD具备智能网联汽车的技术优势,为运营线路落地提供了基础设施保障。不单涉及自动驾驶,智能公交还提供客舱的智能化体验。

  但也有观点指出,基因组预测并非用于筛选那些微妙的智商差异,而是针对那些具有显著异常、很可能有智力残疾的胚胎。更多金属软管供应